ウイルスを構成するタンパク質（VP）は、ウイルスベクターの生物活性や免疫原性、安定性に寄与することが知られており、重要品質特性（CQA）とされています。例えば、アデノ随伴ウイルス（AAV）には3種類のVP（VP1、VP2、VP3）が含まれており、それぞれの比率や一次構造（アミノ酸配列）の確認が必要とされています。VPの配列確認には、逆相クロマトグラフィー質量分析（LC-MS）によるインタクト質量分析や、LCタンデム質量分析（LC-MS/MS）を用いたペプチドマッピングが有効です。

インタクト質量分析では、ペプチド結合の切断を行わず、変性または還元処理を施したタンパク質を質量分析装置に導入し、得られた分子の質量情報から配列を確認できます。ペプチドマッピングは、VPの修飾部位を網羅的に探索できる唯一の方法です。この手法では、トリプシンなどの酵素を用いてタンパク質のペプチド結合を切断し、生成されたペプチド断片を分離・検出します。さらに、解析プログラムを用いてこれを解析することで、翻訳後修飾を含むタンパク質のアミノ酸配列を取得できます。また、タンパク質側鎖に生じた数％程度の翻訳後修飾を定量することも可能です。

ユー・メディコでは、AAVをはじめとするウイルスベクターや腫瘍溶解性ウイルスのインタクト質量分析およびペプチドマッピングの受託分析を実施しています。これまでに積み重ねてきた実績と、大阪大学との密接な連携による最新の科学的知見を活かし、高品質なサービスを提供しています。